Visão Geral
O pacote catalogoUCsBR — desenvolvido em R e como aplicativo Shiny — facilita a criação de listas de plantas para as Unidades de Conservação Brasileiras, combinando registros de herbário, removendo duplicatas, extraindo nomes de espécies aceitas, e permitindo revisão taxonômica com imagens e etiquetas de herbário. A lista final é publicada no site do Catálogo de Plantas das Unidades de Conservação do Brasil. O catalogoUCsBR é uma plataforma aberta para criar listas de espécies verificadas, aprimorando a conservação no Brasil com informações precisas e atualizadas sobre biodiversidade.
Aplicativo de Preparação
O aplicativo de preparação dos dados aceita registros de bancos como Jabot, Reflora, INCT Herbário Virtual da Flora e dos Fungos e GBIF, que devem conter o nome da família da planta, nomes das espécies, código de barra do herbário, localidade e nomes e números dos coletores nos formatos xlsx, txt, csv. A partir desses registros, os dados são combinados utilizando o padrão Darwin Core (DwC). Para evitar duplicação, criamos uma chave única baseada no nome da família, sobrenome do coletor e número da coleta. Também organizamos um dicionário de coletores para verificar e corrigir os dados. Nesta etapa, o pacote permite verificar os nomes das espécies usando o banco de dados 'Flora e Funga do Brasil', atualizado mensalmente. Após a verificação e correção dos dados, os registros são mesclados e exportados para gerar uma lista preliminar revisada.
Acesse aqui..Aplicativo de Revisão
No aplicativo de revisão a lista preliminar gerada no app_prepare é disponibilizada para especialistas, que revisam a identificação dos táxons. Eles selecionam um voucher por espécie para confirmar sua presença da unidade de conservação (UC) e corrigem e validam as identificações, com base em imagens e etiquetas de herbário. A amostra selecionada é salva como o voucher da espécie na UC escolhida, e ao final, os vouchers revisados são exportados por família.
Acesse aqui..Aplicativo de Publicação
Após as revisões taxonômicas, que podem ser realizadas por diferentes especialistas, os nomes das espécies aceitas são incorporados à lista definitiva de plantas da UC (importada e combinada família por família revisada, com a indicação de quaisquer vouchers sobrepostos para cada espécie). Em casos de vouchers sobrepostos, cabe ao curador da lista escolher qual voucher representará a espécie na lista final. Por fim, a lista é publicada no Catálogo de Plantas das Unidades de Conservação do Brasil, disponível online.
Acesse aqui..Manual para obtenção de dados
Manual de instruções aplicativo
Conjuntos de dados para testes
Acesse: Dados aplicativo Preparação. Dados aplicativo Revisão. Dados aplicativo Publicação.
Fluxo de trabalho
